بعد الاصابة بالرباط الصليبي المبكرة اعتزال اللعب حيث يقول الجوهري : ”اعتزالي المبكر جعلني أسعى بقوة لتحقيق ما فاتني في الملعب ومع اللاعبين الذين أدربهم”.• درب ناشئي نادي الأهلي، ثم عمل كمدرب مساعد في النادي• درب الأهلي 1982 وليحقق معه أول بطولة إفريقية في تاريخ النادي الأهلي وهى بطولة دوري أبطال أفريقيا بالعام نفسه .• عام 1983 و1984 حقق الجوهري مع نادي الأهلي بطولة كأس مصر .• 1985 قام الجوهري بتدريب الشارقة الإمارتي لفترة قصيرة ثم عاد لتدريب الأهلي مرة آخرى في نفس العام .• 1986 تدريب نادي الأهلي السعودي• 1988 تدريب المنتخب المصري ليحقق حلم التأهل لكأس العالم 1990 .• 1992 فاز بكأس العرب وهو ما عوض خروج الفريق من الدورالأول في كأس الأمم الإفريقية في بداية العام• استقال في يوليو تموز 1993 بعد إخفاقه في التأهل لكأس العالم 1994• تدريب نادي الزمالك عام 1993 وأحرز معه بطولة إفريقيا للأندية ،والسوبر الإفريقي الذي حصل عليه الزمالك متغلباً علي النادي الأهلي وليصبح الجوهري المدرب المصري الأول الذي قام بتدريب قطبي الكرة المصرية .• تدريب نادي الوحدة الإماراتي• تدريب منتخب عمان .• تدريب نادي الشارقة و نادي الوحدة الإماراتيين• عام 1996 : قاد منتخب عمان في كأس الخليج م قبل عودته إلى مصر ليقود المنتخب مرة آخرى .• مارس 1997 عُين الجوهري مدربًا لمنتخب مصر في عقب بداية متعثرة لتصفيات كأس العالم 1998 لكنه لم ينجح في التأهل.• حقق الجوهري لقب كأس الأمم الإفريقية 1998 ليصبح أول من يفوز باللقب الإفريقي كلاعب ومدرب .• يوليو 1999: استقال الجوهري من تدريب مصر عقب خسارة كبيرة 5-1 أمام السعودية في كأس القارات 1999 في المكسيك لكنه عاد لفترة رابعة في مارس 2000 بعد الخروج من الدور الأول في كأس الأمم الافريقية .• 2002 : ينهي الجوهري مشواره مع منتخب مصر بعد خروجه من دور الثمانية في كأس الأمم الإفريقية وإخفاقه في الوصول لكأس العالم 2002• 2002 - 2007 : تدريب منتخب الأردن لكرة القدم ويقوده لدورالثمانية في كأس آسيا 2004 ويستمر معه حتى عام 2007• 2007 - 2009 : عاد إلى مصر وعمل كمستشار في الاتحاد المصري لكرة القدم .• 2009 - 2012 : مستشار الاتحاد الأردني لكرة القدم حتى وفاته في 3 سبتمبر 2012